Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms