Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnna1P26231 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna1P26231 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms