Protein–RNA interactions for Protein: P08425

MSF1, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSF1P08425 PCC1YKR095W-A 267 nt0.28□□□□□ -2.36
MSF1P08425 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.28□□□□□ -2.36
MSF1P08425 COX5BYIL111W 456 nt0.27□□□□□ -2.37
MSF1P08425 YNL211CYNL211C 261 nt0.27□□□□□ -2.37
MSF1P08425 YOR053WYOR053W 342 nt0.27□□□□□ -2.37
MSF1P08425 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.26□□□□□ -2.37
MSF1P08425 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.25□□□□□ -2.37
MSF1P08425 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.24□□□□□ -2.37
MSF1P08425 OST4YDL232W 111 nt0.23□□□□□ -2.37
MSF1P08425 YPL068CYPL068C 882 nt0.23□□□□□ -2.37
MSF1P08425 THO2YNL139C 4794 nt0.23□□□□□ -2.37
MSF1P08425 ATP19YOL077W-A 207 nt0.22□□□□□ -2.37
MSF1P08425 PRP5YBR237W 2550 nt0.21□□□□□ -2.38
MSF1P08425 PRP42YDR235W 1635 nt0.21□□□□□ -2.38
MSF1P08425 HAL9YOL089C 3093 nt0.21□□□□□ -2.38
MSF1P08425 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.21□□□□□ -2.38
MSF1P08425 YNL303WYNL303W 348 nt0.21□□□□□ -2.38
MSF1P08425 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.19□□□□□ -2.38
MSF1P08425 SGF11YPL047W 300 nt0.19□□□□□ -2.38
MSF1P08425 YLR334CYLR334C 381 nt0.18□□□□□ -2.38
MSF1P08425 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.18□□□□□ -2.38
MSF1P08425 YPL225WYPL225W 441 nt0.18□□□□□ -2.38
MSF1P08425 STE5YDR103W 2754 nt0.17□□□□□ -2.38
MSF1P08425 RPS25BYLR333C 327 nt0.17□□□□□ -2.38
MSF1P08425 PRP39YML046W 1890 nt0.17□□□□□ -2.38
MSF1P08425 TAR1YLR154W-C 375 nt0.16□□□□□ -2.38
MSF1P08425 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.15□□□□□ -2.39
MSF1P08425 snR190snR190 190 nt0.15□□□□□ -2.39
MSF1P08425 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.14□□□□□ -2.39
MSF1P08425 YLR434CYLR434C 384 nt0.14□□□□□ -2.39
MSF1P08425 VPS20YMR077C 666 nt0.14□□□□□ -2.39
MSF1P08425 YOR345CYOR345C 351 nt0.14□□□□□ -2.39
MSF1P08425 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.12□□□□□ -2.39
MSF1P08425 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.12□□□□□ -2.39
MSF1P08425 YJL120WYJL120W 324 nt0.12□□□□□ -2.39
MSF1P08425 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.12□□□□□ -2.39
MSF1P08425 MYO1YHR023W 5787 nt0.11□□□□□ -2.39
MSF1P08425 COG8YML071C 1824 nt0.11□□□□□ -2.39
MSF1P08425 YKL063CYKL063C 504 nt0.11□□□□□ -2.39
MSF1P08425 RCO1YMR075W 2055 nt0.1□□□□□ -2.39
MSF1P08425 TAH1YCR060W 336 nt0.1□□□□□ -2.39
MSF1P08425 YAR029WYAR029W 225 nt0.1□□□□□ -2.39
MSF1P08425 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.1□□□□□ -2.39
MSF1P08425 ORC3YLL004W 1851 nt0.1□□□□□ -2.39
MSF1P08425 YHR138CYHR138C 345 nt0.09□□□□□ -2.4
MSF1P08425 YJL007CYJL007C 315 nt0.09□□□□□ -2.4
MSF1P08425 LEE1YPL054W 906 nt0.09□□□□□ -2.4
MSF1P08425 NNF2YGR089W 2811 nt0.09□□□□□ -2.4
MSF1P08425 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.08□□□□□ -2.4
MSF1P08425 snR45snR45 172 nt0.08□□□□□ -2.4
MSF1P08425 RPS26AYGL189C 360 nt0.07□□□□□ -2.4
MSF1P08425 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.07□□□□□ -2.4
MSF1P08425 COX12YLR038C 252 nt0.07□□□□□ -2.4
MSF1P08425 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.06□□□□□ -2.4
MSF1P08425 CSN9YDR179C 489 nt0.06□□□□□ -2.4
MSF1P08425 YLR202CYLR202C 327 nt0.04□□□□□ -2.4
MSF1P08425 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.04□□□□□ -2.4
MSF1P08425 YNL146WYNL146W 303 nt0.03□□□□□ -2.4
MSF1P08425 COY1YKL179C 2040 nt0.01□□□□□ -2.41
MSF1P08425 NIP1YMR309C 2439 nt0.01□□□□□ -2.41
MSF1P08425 YKL136WYKL136W 399 nt0□□□□□ -2.41
MSF1P08425 YPL205CYPL205C 345 nt0□□□□□ -2.41
MSF1P08425 YCR022CYCR022C 345 nt-0.02□□□□□ -2.41
MSF1P08425 YLR282CYLR282C 342 nt-0.02□□□□□ -2.41
MSF1P08425 HTB2YBL002W 396 nt-0.02□□□□□ -2.41
MSF1P08425 SOV1YMR066W 2697 nt-0.03□□□□□ -2.41
MSF1P08425 ULI1YFR026C 510 nt-0.03□□□□□ -2.41
MSF1P08425 YPR092WYPR092W 306 nt-0.03□□□□□ -2.41
MSF1P08425 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-0.04□□□□□ -2.42
MSF1P08425 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.05□□□□□ -2.42
MSF1P08425 YBR285WYBR285W 435 nt-0.05□□□□□ -2.42
MSF1P08425 RPL35AYDL191W 363 nt-0.06□□□□□ -2.42
MSF1P08425 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.06□□□□□ -2.42
MSF1P08425 YAR053WYAR053W 297 nt-0.06□□□□□ -2.42
MSF1P08425 PRM3YPL192C 402 nt-0.06□□□□□ -2.42
MSF1P08425 YKU70YMR284W 1809 nt-0.07□□□□□ -2.42
MSF1P08425 SSS1YDR086C 243 nt-0.07□□□□□ -2.42
MSF1P08425 YER137W-AYER137W-A 306 nt-0.07□□□□□ -2.42
MSF1P08425 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.07□□□□□ -2.42
MSF1P08425 YOR121CYOR121C 306 nt-0.07□□□□□ -2.42
MSF1P08425 YEL073CYEL073C 324 nt-0.09□□□□□ -2.42
MSF1P08425 YER079WYER079W 633 nt-0.1□□□□□ -2.43
MSF1P08425 RPS27BYHR021C 249 nt-0.1□□□□□ -2.43
MSF1P08425 AGA2YGL032C 264 nt-0.11□□□□□ -2.43
MSF1P08425 YLR041WYLR041W 321 nt-0.11□□□□□ -2.43
MSF1P08425 YNL324WYNL324W 396 nt-0.11□□□□□ -2.43
MSF1P08425 CSE2YNR010W 450 nt-0.11□□□□□ -2.43
MSF1P08425 CSE1YGL238W 2883 nt-0.12□□□□□ -2.43
MSF1P08425 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.12□□□□□ -2.43
MSF1P08425 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.12□□□□□ -2.43
MSF1P08425 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.13□□□□□ -2.43
MSF1P08425 BLI1YKL061W 342 nt-0.13□□□□□ -2.43
MSF1P08425 YLR232WYLR232W 348 nt-0.14□□□□□ -2.43
MSF1P08425 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.14□□□□□ -2.43
MSF1P08425 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.15□□□□□ -2.43
MSF1P08425 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.15□□□□□ -2.43
MSF1P08425 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.15□□□□□ -2.43
MSF1P08425 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-0.15□□□□□ -2.43
MSF1P08425 YDR048CYDR048C 315 nt-0.16□□□□□ -2.44
MSF1P08425 BIL1YOR304C-A 231 nt-0.16□□□□□ -2.44
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