Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacng2O88602 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms