Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alx3O70137 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms