Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms