Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms