Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Atxn7l1os1-201ENSMUST00000155877 1836 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm44636-201ENSMUST00000206130 755 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms