Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms