Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms