Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms