Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Patl2A2ARM1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Patl2A2ARM1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms