Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms