Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms