Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AtrnQ9WU60 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AtrnQ9WU60 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms