Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copg1Q9QZE5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copg1Q9QZE5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms