Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ChmlQ9QZD5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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