Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lsm4Q9QXA5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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