Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b2Q9JME5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms