Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms