Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hmg20aQ9DC33 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hmg20aQ9DC33 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hmg20aQ9DC33 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hmg20aQ9DC33 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hmg20aQ9DC33 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hmg20aQ9DC33 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hmg20aQ9DC33 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hmg20aQ9DC33 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hmg20aQ9DC33 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hmg20aQ9DC33 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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