Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms