Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms