Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cep41Q99NF3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms