Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DhddsQ99KU1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DhddsQ99KU1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms