Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab28Q99KL7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab28Q99KL7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms