Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms