Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCL2

Sco2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco2Q8VCL2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sco2Q8VCL2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms