Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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