Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NfascQ810U3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms