Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms