Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms