Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScocQ78YZ6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms