Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms