Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NinlQ6ZQ12 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NinlQ6ZQ12 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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