Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim45Q6PFY8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms