Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms