Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms