Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab42Q0PD08 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms