Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm3P62311 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms