Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abce1P61222 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abce1P61222 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms