Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf3P61205 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms