Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdhd1P59328 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Wdhd1P59328 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms