Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
PvalbP32848 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PvalbP32848 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms