Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a1P19437 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a1P19437 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms