Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms