Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa1P11477 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms