Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms