Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Casp8O89110 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casp8O89110 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms