Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syngr2O55101 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms